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云栖社区>容器服务 Docker&Kubernetes> 博客>正文
阚俊宝 2020-01-19 15:37:33 浏览 293
数据处理
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API
数据类型
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AGS Remote API 介绍:
阿里云基因计算服务 (AGS) 是一个依托于云计算平台, 使用容器, 工作流等云原生技术, 针对生信行业基因数据处理的整体解决方案. 您可以不用关心基因数据处理过程中的计算资源, 处理逻辑, 数据缓存等细节, 只需要将您的源数据 (Fastq 文件) 地址提供给 ags,ags 既可高效, 快速完成整个数据分析流程, 并将结果数据上传到您期望的存储空间.
AGS 目前支持通用的生信流程包括:
wgs 流程: 支持 GATK 标准流程进行全基因组测序, 支持 GPU 加速;
Mapping: 支持输出包含 MarkUp 和不包含 MarkUp 的 Bam 数据;
AGS 提供用户命令行工具, 通过命令行可以实现远程提交任务. 根据您的数据处理需求, 通过定义具体参数指定 Fastq 数据源, 和处理逻辑. AGS Remote API 目前主要基于阿里云公共云服务, 推荐的数据提供方式为
来源: https://yq.aliyun.com/articles/742988